館内は北館と南館に分かれており、北館の目玉はイルカショー（イルカのパフォーマンス）である。イルカショーは、屋根付きの屋外スタジアムで見るため、冬季に行く場合には温かい格好をして行くのがお勧め。また、事前にショーの開始時間を確認して行こう。そして南館の目玉は、シネマ館にある迫力満点の巨大スクリーン「IMAXシアター」。学会期間中は、絶滅した海竜の映画「シーモンスター」と息を呑むような厳しい南極大陸の映画「南極大陸・アンタークティカ」を上映している。他に南館では真鰯が水槽内を縦横無尽に泳ぎ回る「マイワシのトルネード」、ペンギンたちがかわいい「ペンギン水槽」などもいい。館外の港には南極観測船「ふじ」が停泊していて、共通観覧券を購入すれば見学もできる。